Ander va à l'école des magiciens, mais pour arriver plus tôt, il doit faire face à différentes Megikmons, créatures magiques auxquelles il n'est pas préparé. Avec l'aide de sa première baguette magique, il apprendra non seulement à les affronter les uns après les autres, mais aussi à les capturer et à les utiliser plus tard comme arme de lancement.